มหาวิทยาลัยบูรพาได้ให้ความสำคัญกับอุตสาหกรรมโลจิสติกส์มาเป็นระยะเวลานาน โดยมีการเรียนการสอนด้านโลจิสติกและมีนโยบายที่จะส่งเสริมให้มหาวิทยาลัยมีความเป็นเลิศด้านวิชาการเกี่ยวกับทางทะเล จึงได้จัดตั้ง วิทยาลัยการพาณิชยนาวี ขึ้นเมื่อปีพ.ศ.2543 โดยต่อมาได้มีการพัฒนาปรับเปลี่ยนเป็น “คณะโลจิสติกส์” ในปีพ.ศ. 2551 เพื่อเน้นการผลิตบุคคลกรในด้านนี้โดยเฉพาะ
คณะโลจิสติกส์ สาขาการจัดการอุตสาหกรรมพาณิชยนาวี เป็นหลักสูตร 4 ปี มีการจัดการเรียนการสอนเพื่อผลิตบัณฑิตที่มีความรู้ความสามารถในอุตสาหกรรมพาณิชยนาวี ซึ่งมีการดำเนินงานที่ครอบคลุมทั้งทางน้ำและบนบก รวมไปถึงกิจการที่ต่อเนื่องกัน อย่างเช่น ธุรกิจการเดินเรือ อู่ต่อเรือ การซ่อมบำรุง การจัดการท่าเรือ การขนส่งทางทะเล โดยสาขานี้จะเน้นด้านการจัดการขนส่งทางน้ำโดยเฉพาะ เนื่องจากประเทศไทยมีอุตสาหกรรมการขนส่งทางน้ำขนาดใหญ่ในเอเชีย และมีความต้องการกำลงคนด้านพาณิชยนาวีเป็นจำนวนมาก